Sõda oli talupoegadele raske ja neid koormati uute maksudega ning võeti sõjaväkke. Talupojad nägid sakslaste nõrkust ja hakkasid nende vastu välja astuma. 1560 a. septembris algas Lääne-ja Harjumaa talupoegade ülestõus, mille käigus põletati mõisaid ja tapeti aadlikke. Ülestõusu juhiks valiti üks sepp, kes nimetati kuningaks. Järgmisena kogunesid ülestõusnud Koluvere lossi alla, kuid kohalike aadlike ratsavägi suutis nad laiali lüüa. Paljud ülestõusnud sattusid vangi, nende seas ka ülestõusu juht, kes viidi Kuressaarde ja seal neljaks kisuti. Sellega oli ülestõusu selgroog murtud, kuigi üksikud ülestõusnute salgad tegutsesid veel 1561 aastani.